配列名:RSAskr_r1.0
ゲノム配列名 | RSAskr_r1.0 | 系統名 | cv. Okute-Sakurajima |
配列数 | 10 | 染色体数 | 2n = 2x = 18 |
配列長 (bp) | 504,676,864 | N50長 (bp) | 53,944,652 |
遺伝子の数 | 89,915 | 遺伝子数由来ファイル | RSAskr_r1.0.pmol.pep.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 89,915 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio, Sequel | 取得した配列量 | 60.7x |
アセンブリ方法 | Falcon-unzip 1.8 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 538 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) | データソース名 | Raphanus sativus_Genome DataBase |
論文 (DOIコード) | 10.1093/dnares/dsaa010 | データソースURL | http://radish.kazusa.or.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.1%[S:72.1%,D:26.0%],F:0.6%,M:1.3%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:93.5%[S:69.2%,D:24.3%],F:1.1%,M:5.4%,n:1614 |