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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Raphanus sativus , Japanese radish, Radish , ダイコン

Raphanus sativus

Genome Assembly ID:t3726.G003

配列名:RSAskr_r1.0

ゲノム配列の詳細

配列名 RSAskr_r1.0 系統名 cv. Okute-Sakurajima
配列数 10 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 504,676,864 N50長 (bp) 53,944,652
遺伝子の数 89,915 遺伝子数由来ファイル RSAskr_r1.0.pmol.pep.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 89,915 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, Sequel 取得した配列量 60.7x
アセンブリ方法 Falcon-unzip 1.8 推定ゲノムサイズ (Mb) 538
シーケンシングの方法のコメント コメント
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dsaa010 責任著者 Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute)
データソース名 Raphanus sativus Genome DataBase データソースURL http://radish.kazusa.or.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.1%[S:72.1%,D:26.0%],F:0.6%,M:1.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:93.5%[S:69.2%,D:24.3%],F:1.1%,M:5.4%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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