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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Brassica oleracea var. italica , Broccoli , ブロッコリー (italica変種)

Brassica oleracea

Genome Assembly ID:t3712.G005

配列名:BoleraceaHDEM

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 BoleraceaHDEM 系統名 var. italica, HDEM, Broccoli
配列数 129 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 554,977,060 N50長 (bp) 58,257,932
遺伝子の数 61,279 遺伝子数由来ファイル BoleraceaHDEM_proteins.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 61,279 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Nanopore 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 BioNano optical map 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Broccoli
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jean-Marc Aury(Universite Paris-Saclay) データソース名 Chromosome-scale assemblies of plant genomes
論文 (DOIコード) 10.1038/s41477-018-0289-4 データソースURL http://www.genoscope.cns.fr/externe/plants
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.3%[S:83.8%,D:15.5%],F:0.2%,M:0.5%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:96.1%[S:82.3%,D:13.8%],F:1.2%,M:2.7%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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