配列名:BoleraceaHDEM
ゲノム配列名 | BoleraceaHDEM | 系統名 | var. italica, HDEM, Broccoli |
配列数 | 129 | 染色体数 | 2n = 2x = 18 |
配列長 (bp) | 554,977,060 | N50長 (bp) | 58,257,932 |
遺伝子の数 | 61,279 | 遺伝子数由来ファイル | BoleraceaHDEM_proteins.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 61,279 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Nanopore | 取得した配列量 | NA |
アセンブリ方法 | BioNano optical map | 推定ゲノムサイズ (Mb) | NA |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | Broccoli |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Jean-Marc Aury(Universite Paris-Saclay) | データソース名 | Chromosome-scale assemblies of plant genomes |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41477-018-0289-4 | データソースURL | http://www.genoscope.cns.fr/externe/plants |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.3%[S:83.8%,D:15.5%],F:0.2%,M:0.5%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:96.1%[S:82.3%,D:13.8%],F:1.2%,M:2.7%,n:1614 |