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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Brassica oleracea var. capitata , Cabbage , キャベツ (capitata変種)

Brassica oleracea

Genome Assembly ID:t3712.G003

配列名:Brassica_oleracea_JZS_v2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Brassica_oleracea_JZS_v2 系統名 var. capitata, JZS (also named 02-12), Cabbage
配列数 649 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 561,157,886 N50長 (bp) 57,884,551
遺伝子の数 59,064 遺伝子数由来ファイル Brassica_oleracea_JZS_v2.pep.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 59,064 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Hi-C 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 NA 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Cabbage
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Xiaowu Wang (Chinese Academy of Agricultural Sciences) データソース名 BRAD: Brassica Database
論文 (DOIコード) 10.1007/s00122-020-03664-3 データソースURL http://brassicadb.cn
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.6%[S:84.2%,D:15.4%],F:0.1%,M:0.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:98.1%[S:81.9%,D:16.2%],F:0.5%,M:1.4%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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