配列名:Brassica_oleracea_JZS_v2
ゲノム配列名 | Brassica_oleracea_JZS_v2 | 系統名 | var. capitata, JZS (also named 02-12), Cabbage |
配列数 | 649 | 染色体数 | 2n = 2x = 18 |
配列長 (bp) | 561,157,886 | N50長 (bp) | 57,884,551 |
遺伝子の数 | 59,064 | 遺伝子数由来ファイル | Brassica_oleracea_JZS_v2.pep.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 59,064 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Hi-C | 取得した配列量 | NA |
アセンブリ方法 | NA | 推定ゲノムサイズ (Mb) | NA |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | Cabbage |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Xiaowu Wang (Chinese Academy of Agricultural Sciences) | データソース名 | BRAD: Brassica Database |
論文 (DOIコード) | 10.1007/s00122-020-03664-3 | データソースURL | http://brassicadb.cn |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.6%[S:84.2%,D:15.4%],F:0.1%,M:0.3%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:98.1%[S:81.9%,D:16.2%],F:0.5%,M:1.4%,n:1614 |