配列名:B.oleracea_v1.0.chromosomes
ゲノム配列名 | B.oleracea_v1.0.chromosomes | 系統名 | var. capitata, 02-12, Cabbage |
配列数 | 9 | 染色体数 | 2n = 2x = 18 |
配列長 (bp) | 385,006,588 | N50長 (bp) | 40,895,475 |
遺伝子の数 | 35,400 | 遺伝子数由来ファイル | B.oleracea_v1.0.chromosomes.pep |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 35,400 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | NA |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo v. 1.04 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 630 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | Cabbage |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Shengyi Liu (Chinese Academy of Agricultural Sciences) | データソース名 | BRAD: Brassica Database |
論文 (DOIコード) | 10.1038/ncomms4930 | データソースURL | http://brassicadb.cn |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:82.0%[S:71.7%,D:10.3%],F:0.7%,M:17.3%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:78.5%[S:68.6%,D:9.9%],F:2.5%,M:19.0%,n:1614 |