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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Brassica oleracea var. capitata , Cabbage , キャベツ (capitata変種)

Brassica oleracea

Genome Assembly ID:t3712.G002

配列名:B.oleracea_v1.0.chromosomes

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 B.oleracea_v1.0.chromosomes 系統名 var. capitata, 02-12, Cabbage
配列数 9 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 385,006,588 N50長 (bp) 40,895,475
遺伝子の数 35,400 遺伝子数由来ファイル B.oleracea_v1.0.chromosomes.pep
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 35,400 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 SOAPdenovo v. 1.04 推定ゲノムサイズ (Mb) 630
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Cabbage
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Shengyi Liu (Chinese Academy of Agricultural Sciences) データソース名 BRAD: Brassica Database
論文 (DOIコード) 10.1038/ncomms4930 データソースURL http://brassicadb.cn
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:82.0%[S:71.7%,D:10.3%],F:0.7%,M:17.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:78.5%[S:68.6%,D:9.9%],F:2.5%,M:19.0%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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