配列名:Brassica_oleracea.BOL
ゲノム配列名 | Brassica_oleracea.BOL | 系統名 | TO1000DH3, kale-like type |
配列数 | 32,928 | 染色体数 | 2n = 2x = 18 |
配列長 (bp) | 488,622,507 | N50長 (bp) | 48,366,697 |
遺伝子の数 | 59,220 | 遺伝子数由来ファイル | Brassica_oleracea.BOL.pep.all.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 59,220 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, 454 | 取得した配列量 | 94x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo v. 1.05 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 648 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | A doubled haploid line TO1000DH3 derived from B. oleracea cultivar TO1434, kale-like type |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Isobel AP Parkin (Agriculture and Agri-Food Canada), Boulos Chalhoub (Universite Evry Val d'Essonne), Andrew G Sharpe (National Research Council Canada) | データソース名 | Ensembl |
論文 (DOIコード) | 10.1186/gb-2014-15-6-r77 | データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.1%[S:83.1%,D:16.0%],F:0.4%,M:0.5%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:94.5%[S:80.7%,D:13.8%],F:1.2%,M:4.3%,n:1614 |