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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Brassica oleracea var. alboglabra , Chinese kale , チャイニーズケール

Brassica oleracea

Genome Assembly ID:t3712.G001

配列名:Brassica_oleracea.BOL

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Brassica_oleracea.BOL 系統名 TO1000DH3, kale-like type
配列数 32,928 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 488,622,507 N50長 (bp) 48,366,697
遺伝子の数 59,220 遺伝子数由来ファイル Brassica_oleracea.BOL.pep.all.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 59,220 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, 454 取得した配列量 94x
アセンブリ方法 SOAPdenovo v. 1.05 推定ゲノムサイズ (Mb) 648
シーケンシングの方法のコメント NA コメント A doubled haploid line TO1000DH3 derived from B. oleracea cultivar TO1434, kale-like type
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Isobel AP Parkin (Agriculture and Agri-Food Canada), Boulos Chalhoub (Universite Evry Val d'Essonne), Andrew G Sharpe (National Research Council Canada) データソース名 Ensembl
論文 (DOIコード) 10.1186/gb-2014-15-6-r77 データソースURL http://plants.ensembl.org/index.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.1%[S:83.1%,D:16.0%],F:0.4%,M:0.5%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:94.5%[S:80.7%,D:13.8%],F:1.2%,M:4.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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