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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Brassica nigra , Black mustard , クロカラシナ, クロガラシ

Brassica nigra

Genome Assembly ID:t3710.G001

配列名:v1.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 v1.1 系統名 YZ12151
配列数 2,546 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 402,145,558 N50長 (bp) 39,062,406
遺伝子の数 47,953 遺伝子数由来ファイル BniB_pep.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 47,953 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 96.0x
アセンブリ方法 AllPaths v. 44540 推定ゲノムサイズ (Mb) 591
シーケンシングの方法のコメント NA コメント A doubled haploid line
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Mingfang Zhang (Ministry of Agriculture), Sally A Mackenzie (University of Nebraska) データソース名 BRAD: Brassica Database
論文 (DOIコード) 10.1038/ng.3657 データソースURL http://brassicadb.cn
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.2%[S:83.3%,D:15.9%],F:0.3%,M:0.5%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:96.8%[S:81.4%,D:15.4%],F:1.7%,M:1.5%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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