配列名:Darmor-bzh_v10
ゲノム配列名 | Darmor-bzh_v10 | 系統名 | cv. Darmor-bzh |
配列数 | 237 | 染色体数 | 2n = 4x = 38 |
配列長 (bp) | 923,795,763 | N50長 (bp) | 50,218,839 |
遺伝子の数 | 108,190 | 遺伝子数由来ファイル | BnapusDarmor-bzh_proteins.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 108,190 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, Nanopore | 取得した配列量 | 93x |
アセンブリ方法 | Redbean v2.3, SMARTdenovo, Flye v2.4.2, Bionano Solve Pipeline version 3.3, Bionano Access version 1.3, BiSCoT | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 862 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | A French winter variety |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Mathieu Rousseau-Gueutin (Universite de Rennes), Jean-Marc Aury(Universite Paris-Saclay) | データソース名 | Chromosome-scale assemblies of plant genomes |
論文 (DOIコード) | 10.1093/gigascience/giaa137 | データソースURL | http://www.genoscope.cns.fr/externe/plants |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.5%[S:6.0%,D:93.5%],F:0.1%,M:0.4%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:98.1%[S:6.6%,D:91.5%],F:0.5%,M:1.4%,n:1614 |