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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Brassica napus , Rapeseed , セイヨウアブラナ

Brassica napus

Genome Assembly ID:t3708.G001

配列名:Brassica_napus_v4.1.chromosomes

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Brassica_napus_v4.1.chromosomes 系統名 cv. Darmor-bzh
配列数 41 染色体数 2n = 4x = 38
配列長 (bp) 850,292,103 N50長 (bp) 38,829,317
遺伝子の数 101,040 遺伝子数由来ファイル Brassica_napus.annotation_v5.pep.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 101,040 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Sanger, 454 取得した配列量 22x
アセンブリ方法 SOAP, GapCloser 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,125
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Boulos Chalhoub (French National Institute for Agriculture, Food, and Environment) データソース名 Genoscope Brassica napus Genome Browser
論文 (DOIコード) 10.1126/science.1253435 データソースURL https://www.genoscope.cns.fr/brassicanapus/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.4%[S:7.8%,D:91.6%],F:0.1%,M:0.5%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:97.7%[S:6.8%,D:90.9%],F:0.4%,M:1.9%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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