配列名:Brassica_napus_v4.1.chromosomes
ゲノム配列名 | Brassica_napus_v4.1.chromosomes | 系統名 | cv. Darmor-bzh |
配列数 | 41 | 染色体数 | 2n = 4x = 38 |
配列長 (bp) | 850,292,103 | N50長 (bp) | 38,829,317 |
遺伝子の数 | 101,040 | 遺伝子数由来ファイル | Brassica_napus.annotation_v5.pep.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 101,040 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Sanger, 454 | 取得した配列量 | 22x |
アセンブリ方法 | SOAP, GapCloser | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,125 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Boulos Chalhoub (French National Institute for Agriculture, Food, and Environment) | データソース名 | Genoscope Brassica napus Genome Browser |
論文 (DOIコード) | 10.1126/science.1253435 | データソースURL | https://www.genoscope.cns.fr/brassicanapus/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.4%[S:7.8%,D:91.6%],F:0.1%,M:0.5%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:97.7%[S:6.8%,D:90.9%],F:0.4%,M:1.9%,n:1614 |