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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Brassica juncea var. T84-66 (tumida) , Leaf mustard (T84-66, tumida) , セイヨウカラシナ(T84-66変種, tumida変種)

Brassica juncea

Genome Assembly ID:t3707.G001

配列名:v1.5

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 v1.5 系統名 var. T84-66, var. tumida
配列数 1,966 染色体数 2n = 4x = 36
配列長 (bp) 937,030,072 N50長 (bp) 42,666,085
遺伝子の数 79,644 遺伝子数由来ファイル Bju.chr.modified_id.pep.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 79,644 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio, Bionano 取得した配列量 410.0x
アセンブリ方法 AllPaths v. 44540 推定ゲノムサイズ (Mb) 922
シーケンシングの方法のコメント NA コメント var. T84-66 (var. tumida)
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Mingfang Zhang (Ministry of Agriculture), Sally A Mackenzie (University of Nebraska) データソース名 BRAD: Brassica Database
論文 (DOIコード) 10.1038/ng.3657 データソースURL http://brassicadb.cn
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.6%[S:9.1%,D:90.5%],F:0.1%,M:0.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:95.3%[S:20.1%,D:75.2%],F:2.4%,M:2.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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