配列名:v1.5
ゲノム配列名 | v1.5 | 系統名 | var. T84-66, var. tumida |
配列数 | 1,966 | 染色体数 | 2n = 4x = 36 |
配列長 (bp) | 937,030,072 | N50長 (bp) | 42,666,085 |
遺伝子の数 | 79,644 | 遺伝子数由来ファイル | Bju.chr.modified_id.pep.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 79,644 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, PacBio, Bionano | 取得した配列量 | 410.0x |
アセンブリ方法 | AllPaths v. 44540 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 922 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | var. T84-66 (var. tumida) |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Mingfang Zhang (Ministry of Agriculture), Sally A Mackenzie (University of Nebraska) | データソース名 | BRAD: Brassica Database |
論文 (DOIコード) | 10.1038/ng.3657 | データソースURL | http://brassicadb.cn |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.6%[S:9.1%,D:90.5%],F:0.1%,M:0.3%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:95.3%[S:20.1%,D:75.2%],F:2.4%,M:2.3%,n:1614 |