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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Arabidopsis thaliana , Thale cress , シロイヌナズナ

Arabidopsis thaliana

Genome Assembly ID:t3702.G001

配列名:TAIR10

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 TAIR10 系統名 ecotype Col-0
配列数 7 染色体数 2n = 2x = 10
配列長 (bp) 119,667,750 N50長 (bp) 23,459,830
遺伝子の数 27,655 遺伝子数由来ファイル Araport11_genes.201606.pep.repr.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 48,359 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Sanger, Illumina 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 SPAdes, Velvet v. 1.2.10 推定ゲノムサイズ (Mb) 125
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 The ArabidopsisGenome Initiative データソース名 Araport
論文 (DOIコード) 10.1038/35048692 データソースURL https://www.araport.org/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.3%[S:98.6%,D:0.7%],F:0.2%,M:0.5%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.6%[S:98.9%,D:0.7%],F:0.1%,M:0.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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