配列名:TAIR10
ゲノム配列名 | TAIR10 | 系統名 | ecotype Col-0 |
配列数 | 7 | 染色体数 | 2n = 2x = 10 |
配列長 (bp) | 119,667,750 | N50長 (bp) | 23,459,830 |
遺伝子の数 | 27,655 | 遺伝子数由来ファイル | Araport11_genes.201606.pep.repr.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 48,359 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Sanger, Illumina | 取得した配列量 | NA |
アセンブリ方法 | SPAdes, Velvet v. 1.2.10 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 125 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | The ArabidopsisGenome Initiative | データソース名 | Araport |
論文 (DOIコード) | 10.1038/35048692 | データソースURL | https://www.araport.org/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.3%[S:98.6%,D:0.7%],F:0.2%,M:0.5%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:99.6%[S:98.9%,D:0.7%],F:0.1%,M:0.3%,n:1614 |