配列名:Pop_tri_v4.0
ゲノム配列名 | Pop_tri_v4.0 | 系統名 | Nisqually-1 |
配列数 | 46 | 染色体数 | 2n = 2x = 38 |
配列長 (bp) | 392,162,179 | N50長 (bp) | 21,678,634 |
遺伝子の数 | 52,400 | 遺伝子数由来ファイル | Ptrichocarpa_533_v4.1.protein.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 52,400 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, Sanger | 取得した配列量 | 8x |
アセンブリ方法 | ARACHNE_modified v. 200721016 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 485 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | G. A. Tuskan (Oak Ridge National Laboratory) | データソース名 | Phytozome |
論文 (DOIコード) | 10.1126/science.1128691 | データソースURL | https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.8%[S:82.4%,D:16.4%],F:0.5%,M:0.7%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:99.2%[S:60.8%,D:38.4%],F:0.2%,M:0.6%,n:1614 |