配列名:Lsiceraria_v1
ゲノム配列名 | Lsiceraria_v1 | 系統名 | USVL1VR-Ls |
配列数 | 12 | 染色体数 | 2n = 2x = 22 |
配列長 (bp) | 313,812,576 | N50長 (bp) | 29,011,937 |
遺伝子の数 | 22,472 | 遺伝子数由来ファイル | Lsiceraria_v1.protein.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 22,472 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 751.7x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo v. 2.04 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 334 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Zhangjun Fei (Cornell University), Kai-Shu Ling (USDA遯カ讀紅riculture Research Service) | データソース名 | CuGenDB |
論文 (DOIコード) | 10.1111/tpj.13722 | データソースURL | http://cucurbitgenomics.org/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.5%[S:97.8%,D:0.7%],F:0.4%,M:1.1%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:86.3%[S:85.4%,D:0.9%],F:7.4%,M:6.3%,n:1614 |