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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Lagenaria siceraria , Bottle gourd , ヒョウタン

Lagenaria siceraria

Genome Assembly ID:t3668.G001

配列名:Lsiceraria_v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Lsiceraria_v1 系統名 USVL1VR-Ls
配列数 12 染色体数 2n = 2x = 22
配列長 (bp) 313,812,576 N50長 (bp) 29,011,937
遺伝子の数 22,472 遺伝子数由来ファイル Lsiceraria_v1.protein.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 22,472 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 751.7x
アセンブリ方法 SOAPdenovo v. 2.04 推定ゲノムサイズ (Mb) 334
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Zhangjun Fei (Cornell University), Kai-Shu Ling (USDA遯カ讀紅riculture Research Service) データソース名 CuGenDB
論文 (DOIコード) 10.1111/tpj.13722 データソースURL http://cucurbitgenomics.org/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.5%[S:97.8%,D:0.7%],F:0.4%,M:1.1%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:86.3%[S:85.4%,D:0.9%],F:7.4%,M:6.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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