配列名:Cmaxima_v1.1
ゲノム配列名 | Cmaxima_v1.1 | 系統名 | cv. Rimu |
配列数 | 21 | 染色体数 | 2n = 2x = 40 |
配列長 (bp) | 279,691,401 | N50長 (bp) | 10,608,204 |
遺伝子の数 | 32,076 | 遺伝子数由来ファイル | Cmaxima_v1.1.protein.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 32,076 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 282.7x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo v. 2.04 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 387 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Shan Wu (Cornell University), Zhangjun Fei (ditto), Yong Xu (Beijing Key Laboratory of Vegetable Germplasm Improvement) | データソース名 | CuGenDB |
論文 (DOIコード) | 10.1016/j.molp.2017.09.003 | データソースURL | http://cucurbitgenomics.org/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.4%[S:84.6%,D:13.8%],F:0.6%,M:1.0%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:95.5%[S:82.3%,D:13.2%],F:2.0%,M:2.5%,n:1614 |