配列名:Charmono_v1.1
ゲノム配列名 | Charmono_v1.1 | 系統名 | ssp. melo, var. cantalupensis, cv. Charmono |
配列数 | 13 | 染色体数 | 2n = 2x = 24 |
配列長 (bp) | 365,081,742 | N50長 (bp) | 29,901,275 |
遺伝子の数 | 31,348 | 遺伝子数由来ファイル | Charmono_pep_v1.1.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Sequel annd RSII | 取得した配列量 | 70.34x (PacBio Sequel), 55.88x (PacBio RSII) |
アセンブリ方法 | CANU 1.6 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | NA |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Abdelhafid Bendahmane(Paris-Saclay University) | データソース名 | CuGenDB |
論文 (DOIコード) | 10.1016/j.isci.2021.103696 | データソースURL | http://cucurbitgenomics.org/v2/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |
ゲノム配列データは登録されていません。