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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Cucumis melo var. cantalupensis , Melon (cantalupensis) , メロン (cantalupensis変種)

Cucumis melo

Genome Assembly ID:t3656.G005

配列名:Charmono_v1.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Charmono_v1.1 系統名 ssp. melo, var. cantalupensis, cv. Charmono
配列数 13 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 365,081,742 N50長 (bp) 29,901,275
遺伝子の数 31,348 遺伝子数由来ファイル Charmono_pep_v1.1.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel annd RSII 取得した配列量 70.34x (PacBio Sequel), 55.88x (PacBio RSII)
アセンブリ方法 CANU 1.6 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Abdelhafid Bendahmane(Paris-Saclay University) データソース名 CuGenDB
論文 (DOIコード) 10.1016/j.isci.2021.103696 データソースURL http://cucurbitgenomics.org/v2/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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