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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Cucumis melo subsp. agrestis , Wild melon (agrestis) , メロン野生種 (agrestis亜種), ザッソウメロン

Cucumis melo

Genome Assembly ID:t3656.G004

配列名:IVF77_v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 IVF77_v1 系統名 ssp. agrestis, cv. IVF77
配列数 785 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 364,262,376 N50長 (bp) 26,751,945
遺伝子の数 27,073 遺伝子数由来ファイル IVF77_pep.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio RSII 取得した配列量 84x
アセンブリ方法 Canu (v1.5), DBG2LOC 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Bingyan Xie(Chinese Academy of Agricultural Sciences) データソース名 CuGenDB
論文 (DOIコード) 10.1111/tpj.15279 データソースURL http://cucurbitgenomics.org/v2/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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