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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Cucumis melo , Melon , メロン

Cucumis melo

Genome Assembly ID:t3656.G001

配列名:CM3.6.1_pseudomol

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 CM3.6.1_pseudomol 系統名 DHL92
配列数 13 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 417,002,282 N50長 (bp) 34,318,044
遺伝子の数 29,980 遺伝子数由来ファイル CM4.0_protein.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 29,980 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, 454, Sanger 取得した配列量 13.52x
アセンブリ方法 Newbler 2.5 推定ゲノムサイズ (Mb) 450
シーケンシングの方法のコメント NA コメント A double-haploid line, derived from the cross between PI 161375 (Songwhan Charmi, spp. agrestis) and the 'Piel de Sapo' T111 line (ssp. inodorus)
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jordi Garcia-Mas (Centre for Research in Agricultural Genomics Consejo Superior de Investigaciones Cientificas-Institut deRecerca i Tecnologia Agroalimentaries-Universitat Autonoma de Barcelona-Universitat de Barcelona), Pere Puigdomenech (ditto) データソース名 CuGenDB
論文 (DOIコード) 10.1073/pnas.1205415109 データソースURL http://cucurbitgenomics.org/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.2%[S:97.0%,D:1.2%],F:1.1%,M:0.7%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:90.2%[S:89.0%,D:1.2%],F:6.3%,M:3.5%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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