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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Citrullus lanatus , Watermelon , スイカ

Citrullus lanatus

Genome Assembly ID:t3654.G003

配列名:97103_genome_v2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 97103_genome_v2 系統名 cv. 97103
配列数 113 染色体数 2n = 2x = 22
配列長 (bp) 365,450,462 N50長 (bp) 35,099,344
遺伝子の数 22,596 遺伝子数由来ファイル 97103_pep_v2.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 22,596 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, Hi-C, Bionano 取得した配列量 47.2x
アセンブリ方法 NA 推定ゲノムサイズ (Mb) 425
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 NA データソース名 CuGenDB
論文 (DOIコード) データソースURL http://cucurbitgenomics.org/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.6%[S:97.4%,D:1.2%],F:0.1%,M:1.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:93.2%[S:91.9%,D:1.3%],F:3.6%,M:3.2%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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