配列名:watermelon_v1
ゲノム配列名 | watermelon_v1 | 系統名 | cv. 97103 |
配列数 | 12 | 染色体数 | 2n = 2x = 22 |
配列長 (bp) | 355,247,419 | N50長 (bp) | 28,939,167 |
遺伝子の数 | 23,440 | 遺伝子数由来ファイル | watermelon_v1.pep |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 23,440 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 108.6x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 425 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Yong Xu (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops (North China)), Yunfu Li (ditto), Zhangjun Fei (Cornell University), Jun Wang (University of Copenhagen) | データソース名 | CuGenDB |
論文 (DOIコード) | 10.1038/ng.2470 | データソースURL | http://cucurbitgenomics.org/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.3%[S:97.2%,D:1.1%],F:1.1%,M:0.6%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:83.0%[S:81.7%,D:1.3%],F:9.4%,M:7.6%,n:1614 |