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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Citrullus lanatus , Watermelon , スイカ

Citrullus lanatus

Genome Assembly ID:t3654.G002

配列名:watermelon_v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 watermelon_v1 系統名 cv. 97103
配列数 12 染色体数 2n = 2x = 22
配列長 (bp) 355,247,419 N50長 (bp) 28,939,167
遺伝子の数 23,440 遺伝子数由来ファイル watermelon_v1.pep
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 23,440 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 108.6x
アセンブリ方法 SOAPdenovo 推定ゲノムサイズ (Mb) 425
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Yong Xu (Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops (North China)), Yunfu Li (ditto), Zhangjun Fei (Cornell University), Jun Wang (University of Copenhagen) データソース名 CuGenDB
論文 (DOIコード) 10.1038/ng.2470 データソースURL http://cucurbitgenomics.org/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.3%[S:97.2%,D:1.1%],F:1.1%,M:0.6%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:83.0%[S:81.7%,D:1.3%],F:9.4%,M:7.6%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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