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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Citrullus lanatus , Watermelon , スイカ

Citrullus lanatus

Genome Assembly ID:t3654.G001

配列名:WCG_chromosome_v2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 WCG_chromosome_v2 系統名 cv. Charleston Gray
配列数 12 染色体数 2n = 2x = 22
配列長 (bp) 404,611,775 N50長 (bp) 33,982,080
遺伝子の数 22,546 遺伝子数由来ファイル WCG_protein_v2.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 22,546 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 228x
アセンブリ方法 SOAPdenovo v. 2 推定ゲノムサイズ (Mb) 425
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Zhangjun Fei (Cornell University), Amnon Levi (U.S. Vegetable Laboratory) データソース名 CuGenDB
論文 (DOIコード) 10.1111/pbi.13136 データソースURL http://cucurbitgenomics.org/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.1%[S:97.6%,D:1.5%],F:0.1%,M:0.8%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:90.9%[S:89.2%,D:1.7%],F:4.2%,M:4.9%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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