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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Carica papaya , Mamon, Papaya , パパイヤ

Carica papaya

Genome Assembly ID:t3649.G002

配列名:GWHBFSC00000000

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHBFSC00000000 系統名 cv. SunUp
配列数 869 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 351,471,749 N50長 (bp) 36,982,309
遺伝子の数 24,702 遺伝子数由来ファイル GWHBFSC00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 24,702 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Oxford Nanopore, Hi-C 取得した配列量 90x
アセンブリ方法 NECAT v0.0.1, BWA v0.7.8, ALLHiC v0.9.13 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Ray Ming (University of Illinois at Urbana-Champaign) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1038/s41588-022-01068-1 データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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