配列名:Hai7124_V1.1
ゲノム配列名 | Hai7124_V1.1 | 系統名 | cv. Hai7124 |
配列数 | 11,350 | 染色体数 | 2n = 4x = 52 |
配列長 (bp) | 2,226,679,100 | N50長 (bp) | 101,615,779 |
遺伝子の数 | 75,071 | 遺伝子数由来ファイル | Hai7124_V1.1.gene.pep.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 75,071 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | NA |
アセンブリ方法 | DeNovoMAGIC3, BioNano, Hi-C, and POPSEQ | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 2,470 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Tianzhen Zhang (Zhejiang University) | データソース名 | COTTON GEN |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41588-019-0371-5 | データソースURL | https://www.cottongen.org/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.6%[S:8.3%,D:91.3%],F:0.2%,M:0.2%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:97.9%[S:7.4%,D:90.5%],F:0.1%,M:2.0%,n:1614 |