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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Gossypium barbadense , Sea Island cotton , ワタ (barbadense種), カイトウメン

Gossypium barbadense

Genome Assembly ID:t3634.G001

配列名:Hai7124_V1.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Hai7124_V1.1 系統名 cv. Hai7124
配列数 11,350 染色体数 2n = 4x = 52
配列長 (bp) 2,226,679,100 N50長 (bp) 101,615,779
遺伝子の数 75,071 遺伝子数由来ファイル Hai7124_V1.1.gene.pep.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 75,071 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 DeNovoMAGIC3, BioNano, Hi-C, and POPSEQ 推定ゲノムサイズ (Mb) 2,470
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Tianzhen Zhang (Zhejiang University) データソース名 COTTON GEN
論文 (DOIコード) 10.1038/s41588-019-0371-5 データソースURL https://www.cottongen.org/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.6%[S:8.3%,D:91.3%],F:0.2%,M:0.2%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:97.9%[S:7.4%,D:90.5%],F:0.1%,M:2.0%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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