配列名:Hongyang_genome_v3.0_update
ゲノム配列名 | Hongyang_genome_v3.0_update | 系統名 | female of cv. Hong Yang |
配列数 | 1,720 | 染色体数 | 2n = 2x = 58 |
配列長 (bp) | 653,926,268 | N50長 (bp) | 19,959,221 |
遺伝子の数 | 40,466 | 遺伝子数由来ファイル | Hongyang_pep_v3.0.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 40,466 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio, Hi-C | 取得した配列量 | 116x |
アセンブリ方法 | Canu v. 1.5, Falcon v 0.7, WTDBG v. 1.2.8, Quickmerge | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 638 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | A heterozygous kiwifruit, 遯カ霍ッongyang遯カ |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Jianquan Liu (1.Sichuan University, 2.Lanzhou University) | データソース名 | Kiwifruit Genome Database |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41438-019-0202-y | データソースURL | http://kiwifruitgenome.org/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:96.4%[S:78.4%,D:18.0%],F:1.5%,M:2.1%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:87.3%[S:76.3%,D:11.0%],F:5.9%,M:6.8%,n:1614 |