配列名:Red5_PS1_1.69.0
ゲノム配列名 | Red5_PS1_1.69.0 | 系統名 | Red5 |
配列数 | 1,234 | 染色体数 | 2n = 2x = 58 |
配列長 (bp) | 553,842,477 | N50長 (bp) | 18,944,233 |
遺伝子の数 | 33,115 | 遺伝子数由来ファイル | Actinidia_chinensis.Red5_PS1_1.69.0.pep.all.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 33,115 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, 454 | 取得した配列量 | NA |
アセンブリ方法 | Anytag v. 2.5.2, Newbler v. 2.9, SSPACE2 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 758 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | A diploid F3 sibcross individual Red5, with a predicted inbreeding coefficient of 37.5%. |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Robert J. Schaffer (The New Zealand Institute for Plant & Food Research Ltd (PFR)) | データソース名 | Ensembl |
論文 (DOIコード) | 10.1186/s12864-018-4656-3 | データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.0%[S:72.7%,D:25.3%],F:1.4%,M:0.6%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:94.8%[S:74.4%,D:20.4%],F:2.3%,M:2.9%,n:1614 |