配列名:Fagopyrum_esculentum_hap2
ゲノム配列名 | Fagopyrum_esculentum_hap2 | 系統名 | cv. Xinong9976 |
配列数 | 206 | 染色体数 | 2n = 2x = 16 |
配列長 (bp) | 1,209,527,273 | N50長 (bp) | 150,259,016 |
遺伝子の数 | 52,149 | 遺伝子数由来ファイル | Fagopyrum_esculentum_hap2.prot.long.fa.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Sequel II, Hi-C | 取得した配列量 | 26.85x (PacBio), 71.89x (Hi-C) |
アセンブリ方法 | hifiasm, Juicer v1.6.2, 3D-DNA v180922 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,270 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Jianquan Liu (Sichuan University) | データソース名 | Figshare |
論文 (DOIコード) | 10.1186/s12915-023-01587-1 | データソースURL | https://figshare.com |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |