Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Diospyros kaki , Persimmon , カキ

Diospyros kaki

Genome Assembly ID:t35925.G002

配列名:ASM2877740v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ASM2877740v1 系統名 Xiaoguotianshi
配列数 11,978 染色体数 2n = 6x = 90
配列長 (bp) 4,500,528,094 N50長 (bp) 44,013,165
遺伝子の数 153,288 遺伝子数由来ファイル Dka.pep.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel II, Hi-C 取得した配列量 39.53x (PacBIo), 98.39x (Hi-C)
アセンブリ方法 Hifisam v0.13-r308, BWA, ALLHIC v0.9.8 推定ゲノムサイズ (Mb) 4533.56_
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jianmin Fu (Chinese Academy of Forestry) データソース名 NCBI; Figshare
論文 (DOIコード) 10.1038/s41597-023-02175-2 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
https://figshare.com
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット