配列名:ASM2877740v1
ゲノム配列名 | ASM2877740v1 | 系統名 | Xiaoguotianshi |
配列数 | 11,978 | 染色体数 | 2n = 6x = 90 |
配列長 (bp) | 4,500,528,094 | N50長 (bp) | 44,013,165 |
遺伝子の数 | 153,288 | 遺伝子数由来ファイル | Dka.pep.fa.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Sequel II, Hi-C | 取得した配列量 | 39.53x (PacBIo), 98.39x (Hi-C) |
アセンブリ方法 | Hifisam v0.13-r308, BWA, ALLHIC v0.9.8 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 4533.56_ |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Jianmin Fu (Chinese Academy of Forestry) | データソース名 | NCBI; Figshare |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41597-023-02175-2 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ https://figshare.com |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |