配列名:DKA_r1.0
ゲノム配列名 | DKA_r1.0 | 系統名 | Taishu |
配列数 | 16 | 染色体数 | 2n = 6x = 90 |
配列長 (bp) | 708,766,281 | N50長 (bp) | 44,734,305 |
遺伝子の数 | 39,463 | 遺伝子数由来ファイル | DKA_r1.0.pep.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 39,463 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Hifi | 取得した配列量 | 22x |
アセンブリ方法 | Hifiasm | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 3,758 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | Unphased genome |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Takashi Akagi (Okayama University) | データソース名 | PersimmonDB |
論文 (DOIコード) | 10.1093/molbev/msad151 | データソースURL | https://persimmon.kazusa.or.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.2.2 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:95.6%[S:88.5%,D:7.1%],F:0.6%,M:3.8%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:90.9%[S:73.5%,D:17.4%],F:3.3%,M:5.8%,n:1614 |