Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Diospyros kaki , Persimmon , カキ

Diospyros kaki

Genome Assembly ID:t35925.G001

配列名:DKA_r1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 DKA_r1.0 系統名 Taishu
配列数 16 染色体数 2n = 6x = 90
配列長 (bp) 708,766,281 N50長 (bp) 44,734,305
遺伝子の数 39,463 遺伝子数由来ファイル DKA_r1.0.pep.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 39,463 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Hifi 取得した配列量 22x
アセンブリ方法 Hifiasm 推定ゲノムサイズ (Mb) 3,758
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Unphased genome
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Takashi Akagi (Okayama University) データソース名 PersimmonDB
論文 (DOIコード) 10.1093/molbev/msad151 データソースURL https://persimmon.kazusa.or.jp/
BUSCO バージョン 5.2.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:95.6%[S:88.5%,D:7.1%],F:0.6%,M:3.8%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:90.9%[S:73.5%,D:17.4%],F:3.3%,M:5.8%,n:1614

遺伝子をさがす

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット