配列名:NSP323_triloba_chr_v3
ゲノム配列名 | NSP323_triloba_chr_v3 | 系統名 | cv. NCNSP0323 |
配列数 | 16 | 染色体数 | 2n = 2x = 30 |
配列長 (bp) | 461,841,941 | N50長 (bp) | 29,809,665 |
遺伝子の数 | 47,091 | 遺伝子数由来ファイル | NSP323_triloba_v3.hc.gene_models.pep.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 47,091 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, PacBIO | 取得した配列量 | 290.0x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo v. v2; SSPACE v. v2.0; PBJelly v. v15.8.24; Pilon v. v1.13 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 496 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | C. Robin Buell (Michigan State University), Zhangjun Fei (USDA-ARS Robert W. Holley Center for Agriculture and Health) | データソース名 | Sweetpotato Genomics Resource |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41467-018-06983-8 | データソースURL | http://sweetpotato.plantbiology.msu.edu/index.shtml |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.6%[S:93.9%,D:4.7%],F:0.6%,M:0.8%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:96.6%[S:60.2%,D:36.4%],F:1.4%,M:2.0%,n:1614 |