配列名:Itr_r2.2
ゲノム配列名 | Itr_r2.2 | 系統名 | Mx23Hm |
配列数 | 16 | 染色体数 | 2n = 2x = 30 |
配列長 (bp) | 502,237,654 | N50長 (bp) | 31,779,616 |
遺伝子の数 | 34,386 | 遺伝子数由来ファイル | ITR_r2.2_15chr_Mx23Hm.CDS.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 34,501 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio, Hi-C | 取得した配列量 | 124.5x |
アセンブリ方法 | SMRT make | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 516 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Sachiko Isobe (Kazusa DNA Res Inst) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | データソースURL | https://plantgarden.jp/ | |
BUSCO バージョン | 5.2.2 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.5%[S:93.4%,D:5.1%],F:0.8%,M:0.7%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:97.2%[S:9.5%,D:87.7%],F:1.7%,M:1.1%,n:1614 |