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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Ipomoea trifida , Wild sweet potato (trifida) , サツマイモ野生種 (trifida種)

Ipomoea trifida

Genome Assembly ID:t35884.G002

配列名:Itr_r2.2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Itr_r2.2 系統名 Mx23Hm
配列数 16 染色体数 2n = 2x = 30
配列長 (bp) 502,237,654 N50長 (bp) 31,779,616
遺伝子の数 34,386 遺伝子数由来ファイル ITR_r2.2_15chr_Mx23Hm.CDS.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 34,501 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, Hi-C 取得した配列量 124.5x
アセンブリ方法 SMRT make 推定ゲノムサイズ (Mb) 516
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Sachiko Isobe (Kazusa DNA Res Inst) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.2.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.5%[S:93.4%,D:5.1%],F:0.8%,M:0.7%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:97.2%[S:9.5%,D:87.7%],F:1.7%,M:1.1%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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