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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Ipomoea nil , Japanese morning glory , アサガオ

Ipomoea nil

Genome Assembly ID:t35883.G001

配列名:Asagao_1.2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Asagao_1.2 系統名 TKS, Tokyo-kokei standard
配列数 3,110 染色体数 2n = 2x = 30
配列長 (bp) 734,803,496 N50長 (bp) 42,879,674
遺伝子の数 44,916 遺伝子数由来ファイル pep.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 44,916 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, Illumina 取得した配列量 52.6x
アセンブリ方法 HGAP3, BESST 推定ゲノムサイズ (Mb) 750
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Atsushi Hoshino (National Institute for Basic Biology) , Yasubumi Sakakibara (Keio University) データソース名 Ipomoea nil Genome Project
論文 (DOIコード) 10.1038/ncomms13295 データソースURL http://viewer.shigen.info/asagao/download.php
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.8%[S:93.7%,D:5.1%],F:0.6%,M:0.6%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:97.3%[S:85.9%,D:11.4%],F:1.7%,M:1.0%,n:1614

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染色体 /
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fasta
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