配列名:Asagao_1.2
ゲノム配列名 | Asagao_1.2 | 系統名 | TKS, Tokyo-kokei standard |
配列数 | 3,110 | 染色体数 | 2n = 2x = 30 |
配列長 (bp) | 734,803,496 | N50長 (bp) | 42,879,674 |
遺伝子の数 | 44,916 | 遺伝子数由来ファイル | pep.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 44,916 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio, Illumina | 取得した配列量 | 52.6x |
アセンブリ方法 | HGAP3, BESST | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 750 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Atsushi Hoshino (National Institute for Basic Biology) , Yasubumi Sakakibara (Keio University) | データソース名 | Ipomoea nil Genome Project |
論文 (DOIコード) | 10.1038/ncomms13295 | データソースURL | http://viewer.shigen.info/asagao/download.php |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.8%[S:93.7%,D:5.1%],F:0.6%,M:0.6%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:97.3%[S:85.9%,D:11.4%],F:1.7%,M:1.0%,n:1614 |