Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Nitraria sibirica , Desert shrub , ソーダノキ

Nitraria sibirica

Genome Assembly ID:t357931.G001

配列名:Nitraria_sibirica

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Nitraria_sibirica 系統名 NA
配列数 35 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 456,669,332 N50長 (bp) 44,879,802
遺伝子の数 23,365 遺伝子数由来ファイル Nitraria_sibirica.pep.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Oxford Nanopore, Hi-C 取得した配列量 79x (ONT), 116x (Hi-C)
アセンブリ方法 NextDenovo v2.3.0, LACHESIS 推定ゲノムサイズ (Mb) 483
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Shengdan Wu (Lanzhou University) データソース名 Figshare
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dsad011 データソースURL https://figshare.com
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット