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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Spinacia oleracea , Spinach , ホウレンソウ

Spinacia oleracea

Genome Assembly ID:t3562.G004

配列名:Sp75_genome_v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Sp75_genome_v1 系統名 inbred line Sp75
配列数 25,495 染色体数 2n = 2x = 12
配列長 (bp) 9,803,418 N50長 (bp) 522
遺伝子の数 25,495 遺伝子数由来ファイル Sp75_pep_v1.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 168x
アセンブリ方法 Platanus v1.2.1, SOAPdenovo2 v2.04 推定ゲノムサイズ (Mb) 989
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Quanhua Wang (Shanghai Normal University) データソース名 SpinachBase
論文 (DOIコード) 10.1038/ncomms15275 データソースURL http://www.spinachbase.org
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.5%[S:94.7%,D:2.9%],F:1.4%,M:1.1%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:94.4%[S:91.3%,D:3.1%],F:2.2%,M:3.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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