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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Spinacia oleracea , Spinach , ホウレンソウ

Spinacia oleracea

Genome Assembly ID:t3562.G003

配列名:Soleracea_575_Spov3

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Soleracea_575_Spov3 系統名 cv. Viroflay
配列数 287 染色体数 2n = 2x = 12
配列長 (bp) 935,652,614 N50長 (bp) 11,296,190
遺伝子の数 29,276 遺伝子数由来ファイル SOL_r1.1a_pep_HC.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio RSII 取得した配列量 70x
アセンブリ方法 Celera assembler 推定ゲノムサイズ (Mb) 956
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Allen Van Deynze (University of California Davis) データソース名 Phytozome
論文 (DOIコード) 10.1002/tpg2.20101 データソースURL https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.8%[S:95.4%,D:2.5%],F:1.2%,M:0.9%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:86.1%[S:83.8%,D:2.2%],F:3.8%,M:10.1%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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