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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Spinacia oleracea , Spinach , ホウレンソウ

Spinacia oleracea

Genome Assembly ID:t3562.G002

配列名:SOL_r1.0_pseudomolecule

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 SOL_r1.0_pseudomolecule 系統名 03-09
配列数 6 染色体数 2n = 2x = 12
配列長 (bp) 687,989,365 N50長 (bp) 124,699,619
遺伝子の数 0 遺伝子数由来ファイル NA
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, Illumina, 10x Genomics, RAD-Seq 取得した配列量 100.7x
アセンブリ方法 FALCON, Opera-LG, Tigmint, ARKS 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,053
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Hideki Hirakawa(Kazusa DNA Research Institute), Yasuyuki Onodera(Hokkaido Univ.) データソース名 Spinach Genome DataBase
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dsab004 データソースURL http://spinach.kazusa.or.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:81.5%[S:79.7%,D:1.8%],F:1.7%,M:16.8%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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