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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Spinacia oleracea , Spinach , ホウレンソウ

Spinacia oleracea

Genome Assembly ID:t3562.G001

配列名:SOL_r1.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 SOL_r1.1 系統名 03-009
配列数 287 染色体数 2n = 2x =12
配列長 (bp) 935,652,614 N50長 (bp) 11,296,190
遺伝子の数 29,276 遺伝子数由来ファイル SOL_r1.1a_pep_HC.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, Illumina, 10x Genomics 取得した配列量 100.7x
アセンブリ方法 FALCON, Opera-LG, Tigmint, ARKS 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,053
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Hideki Hirakawa(Kazusa DNA Research Institute), Yasuyuki Onodera(Hokkaido Univ.) データソース名 Spinach Genome DataBase
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dsab004 データソースURL http://spinach.kazusa.or.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.8%[S:94.8%,D:3.0%],F:0.9%,M:1.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:93.2%[S:89.3%,D:3.9%],F:2.9%,M:3.9%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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