配列名:SOL_r1.1
ゲノム配列名 | SOL_r1.1 | 系統名 | 03-009 |
配列数 | 287 | 染色体数 | 2n = 2x =12 |
配列長 (bp) | 935,652,614 | N50長 (bp) | 11,296,190 |
遺伝子の数 | 29,276 | 遺伝子数由来ファイル | SOL_r1.1a_pep_HC.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio, Illumina, 10x Genomics | 取得した配列量 | 100.7x |
アセンブリ方法 | FALCON, Opera-LG, Tigmint, ARKS | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,053 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Hideki Hirakawa(Kazusa DNA Research Institute), Yasuyuki Onodera(Hokkaido Univ.) | データソース名 | Spinach Genome DataBase |
論文 (DOIコード) | 10.1093/dnares/dsab004 | データソースURL | http://spinach.kazusa.or.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.8%[S:94.8%,D:3.0%],F:0.9%,M:1.3%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:93.2%[S:89.3%,D:3.9%],F:2.9%,M:3.9%,n:1614 |