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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Betula pendula subsp. pendula , Silver birch (ssp. Pendula) , オウシュウシラカンバ, ヨーロッパシラカバ (pendula亜種)

Betula pendula

Genome Assembly ID:t3505.G001

配列名:Betula_pendula_subsp._pendula

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Betula_pendula_subsp._pendula 系統名 subsp. pendula
配列数 14 染色体数 2n = 28
配列長 (bp) 391,815,048 N50長 (bp) 28,107,484
遺伝子の数 0 遺伝子数由来ファイル NA
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Roche 454, Illumina, PacBio RSII 取得した配列量 9x (454), 109x (Illumina PE), 52x (Illumina MP), 50x (PacBio)
アセンブリ方法 Newbler v2.8, BWA, SSPACE 2, PBJelly, SSPACE-LongRead 推定ゲノムサイズ (Mb) 440
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jaakko Kangasjarvi (University of Helsinki) データソース名 CoGe
論文 (DOIコード) 10.1038/ng.3862 データソースURL https://genomevolution.org/CoGe/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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