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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Ficus carica , Common fig , イチジク

Ficus carica

Genome Assembly ID:t3494.G002

配列名:FCA_r2.3

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 FCA_r2.3 系統名 cv. Horaishi
配列数 14 染色体数 2n = 2x = 26
配列長 (bp) 322,942,267 N50長 (bp) 24,737,479
遺伝子の数 45,309 遺伝子数由来ファイル FCA_r2.3.proteins.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 45,309 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio CLR, BioNano, Genetic mapping 取得した配列量 118x
アセンブリ方法 Falcon 推定ゲノムサイズ (Mb) 319
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Hidetoshi Ikegami (Fukuoka Agriculture and Forestry Research Center Buzen Branch) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1016/j.scienta.2024.113424 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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