配列名:Horaishi_ver.1
ゲノム配列名 | Horaishi_ver.1 | 系統名 | cv. Horaishi |
配列数 | 27,995 | 染色体数 | 2n = 2x = 26 |
配列長 (bp) | 247,090,558 | N50長 (bp) | 166,092 |
遺伝子の数 | 36,138 | 遺伝子数由来ファイル | Horaishi_ver.1.pep.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 36,138 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 60x |
アセンブリ方法 | Platanus | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 356 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | BDEM00000000.1 |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Hidetoshi Ikegami (Fukuoka Agriculture and Forestry Research Center Buzen Branch) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1038/srep41124 | データソースURL | https://plantgarden.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:91.5%[S:91.1%,D:0.4%],F:4.5%,M:4.0%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:86.2%[S:85.1%,D:1.1%],F:7.6%,M:6.2%,n:1614 |