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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Ficus carica , Common fig , イチジク

Ficus carica

Genome Assembly ID:t3494.G001

配列名:Horaishi_ver.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Horaishi_ver.1 系統名 cv. Horaishi
配列数 27,995 染色体数 2n = 2x = 26
配列長 (bp) 247,090,558 N50長 (bp) 166,092
遺伝子の数 36,138 遺伝子数由来ファイル Horaishi_ver.1.pep.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 36,138 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 60x
アセンブリ方法 Platanus 推定ゲノムサイズ (Mb) 356
シーケンシングの方法のコメント NA コメント BDEM00000000.1
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Hidetoshi Ikegami (Fukuoka Agriculture and Forestry Research Center Buzen Branch) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1038/srep41124 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:91.5%[S:91.1%,D:0.4%],F:4.5%,M:4.0%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:86.2%[S:85.1%,D:1.1%],F:7.6%,M:6.2%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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