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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Humulus lupulus var. lupulus , Hop (var. lupulus) , カラハナソウ (lupulus変種)

Humulus lupulus

Genome Assembly ID:t3486.G004

配列名:Hop_Saaz_haploid_v3.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Hop_Saaz_haploid_v3.0 系統名 Saaz
配列数 338 染色体数 2n = 2x = 20
配列長 (bp) 2,521,714,900 N50長 (bp) 247,167,054
遺伝子の数 25,979 遺伝子数由来ファイル Hop_Saaz_1.0_haploid_annotation_v3.0_protein.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 25,979 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Hifi, Omni-C 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 Hifiasm 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Takashi Akagi (Okayama University) データソース名 DDBJ; Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1038/s41477-025-02017-6 データソースURL https://www.ddbj.nig.ac.jp/ddbj/index-e.html
https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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