配列名:hl_KR_version_1.0.fasta
ゲノム配列名 | hl_KR_version_1.0.fasta | 系統名 | var. cordifolius, cv. Karahanasou |
配列数 | 132,476 | 染色体数 | 2n = 20 |
配列長 (bp) | 2,049,208,583 | N50長 (bp) | 37,081 |
遺伝子の数 | 0 | 遺伝子数由来ファイル | NA |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 18.8x |
アセンブリ方法 | CLC Assembly Cell v3.22, SSPACE v2.3, BWA | 推定ゲノムサイズ (Mb) | NA |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | The gap-closed scaffold of 'Shinshu Wase' was used as the draft reference hop genome (hl_version 1.0). The authers were employed it as the basis for resequencing the 'Karahanasou'. |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Eiichiro Ono (Suntory Global Innovation Center (SIC) Ltd.) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1093/pcp/pcu169 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |