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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Humulus lupulus var. cordifolius , Hop (var. cordifolius) , ホップ (cordifolius変種), セイヨウカラハナソウ

Humulus lupulus

Genome Assembly ID:t3486.G002

配列名:hl_KR_version_1.0.fasta

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 hl_KR_version_1.0.fasta 系統名 var. cordifolius, cv. Karahanasou
配列数 132,476 染色体数 2n = 20
配列長 (bp) 2,049,208,583 N50長 (bp) 37,081
遺伝子の数 0 遺伝子数由来ファイル NA
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 18.8x
アセンブリ方法 CLC Assembly Cell v3.22, SSPACE v2.3, BWA 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント The gap-closed scaffold of 'Shinshu Wase' was used as the draft reference hop genome (hl_version 1.0). The authers were employed it as the basis for resequencing the 'Karahanasou'.
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Eiichiro Ono (Suntory Global Innovation Center (SIC) Ltd.) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1093/pcp/pcu169 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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