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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Papaver somniferum subsp. setigerum , Troy poppy , アツミゲシ, ケシ (setigerum亜種)

Papaver somniferum

Genome Assembly ID:t3469.G002

配列名:GWHAZPH00000000

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHAZPH00000000 系統名 subsp. setigerum, var. DCW1
配列数 381 染色体数 2n = 2x = 44
配列長 (bp) 4,590,117,772 N50長 (bp) 211,159,933
遺伝子の数 106,517 遺伝子数由来ファイル Papaver_setigerum.pep.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Oxford Nanopore 取得した配列量 86x (regular-long ONT reads), 19x (ultra-long ONT reads)
アセンブリ方法 NA 推定ゲノムサイズ (Mb) 4,820
シーケンシングの方法のコメント For ONT sequencing, high molecular weight (regular) and ultra-high molecular weight DNA was used for regular and ultra-long library construction, respectively. コメント The sequence data used for de novo assembly included regular and ultra-long ONT reads. Synonym: Papaver somniferum subsp. Setigerum.
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kai Ye (Xi'an Jiaotong University) データソース名 Genome Warehouse; Papaver species Genomic Data Page
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-021-26330-8 データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
https://xjtu-omics.github.io/Papaver-Genomics/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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