配列名:GWHAZPH00000000
ゲノム配列名 | GWHAZPH00000000 | 系統名 | subsp. setigerum, var. DCW1 |
配列数 | 381 | 染色体数 | 2n = 2x = 44 |
配列長 (bp) | 4,590,117,772 | N50長 (bp) | 211,159,933 |
遺伝子の数 | 106,517 | 遺伝子数由来ファイル | Papaver_setigerum.pep.fa.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Oxford Nanopore | 取得した配列量 | 86x (regular-long ONT reads), 19x (ultra-long ONT reads) |
アセンブリ方法 | NA | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 4,820 |
シーケンシングの方法のコメント | For ONT sequencing, high molecular weight (regular) and ultra-high molecular weight DNA was used for regular and ultra-long library construction, respectively. | コメント | The sequence data used for de novo assembly included regular and ultra-long ONT reads. Synonym: Papaver somniferum subsp. Setigerum. |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Kai Ye (Xi'an Jiaotong University) | データソース名 | Genome Warehouse; Papaver species Genomic Data Page |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41467-021-26330-8 | データソースURL | https://bigd.big.ac.cn/gwh/ https://xjtu-omics.github.io/Papaver-Genomics/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |