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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Papaver somniferum , Opium poppy , ケシ

Papaver somniferum

Genome Assembly ID:t3469.G001

配列名:ASM357369v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ASM357369v1 系統名 cv. HN1
配列数 34,381 染色体数 2n = 2x = 22
配列長 (bp) 2,715,530,335 N50長 (bp) 204,470,928
遺伝子の数 84,179 遺伝子数由来ファイル GCF_003573695.1_ASM357369v1_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 84,179 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina HiSeq, PacBio, 10X, Nanopore 取得した配列量 239.0x
アセンブリ方法 DeNovoMAGIC v. 3.0; Falcon v. 3.1 推定ゲノムサイズ (Mb) 2,870
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Ian A. Graham (University of York), Kai Ye (Xi'an Jiaotong University) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1126/science.aat4096 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.0%[S:11.3%,D:86.7%],F:0.9%,M:1.1%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.0%[S:11.6%,D:87.4%],F:0.2%,M:0.8%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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