配列名:ASM357369v1
ゲノム配列名 | ASM357369v1 | 系統名 | cv. HN1 |
配列数 | 34,381 | 染色体数 | 2n = 2x = 22 |
配列長 (bp) | 2,715,530,335 | N50長 (bp) | 204,470,928 |
遺伝子の数 | 84,179 | 遺伝子数由来ファイル | GCF_003573695.1_ASM357369v1_protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 84,179 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina HiSeq, PacBio, 10X, Nanopore | 取得した配列量 | 239.0x |
アセンブリ方法 | DeNovoMAGIC v. 3.0; Falcon v. 3.1 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 2,870 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Ian A. Graham (University of York), Kai Ye (Xi'an Jiaotong University) | データソース名 | NCBI |
論文 (DOIコード) | 10.1126/science.aat4096 | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.0%[S:11.3%,D:86.7%],F:0.9%,M:1.1%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:99.0%[S:11.6%,D:87.4%],F:0.2%,M:0.8%,n:1614 |