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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Lotus japonicus , Japanese trefoil , ミヤコグサ

Lotus japonicus

Genome Assembly ID:t34305.G002

配列名:Lj3.0

ゲノム配列の詳細

配列名 Lj3.0 系統名 Miyakojima MG-20
配列数 9 染色体数 2n = 2x = 12
配列長 (bp) 447,416,816 N50長 (bp) 62,285,374
遺伝子の数 48,105 遺伝子数由来ファイル Lj3.0_pep.fna
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 48,105 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Sanger, Illumina, 454 取得した配列量 35x
アセンブリ方法 Paracel Genome Assembler 推定ゲノムサイズ (Mb) 465
シーケンシングの方法のコメント コメント
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dsn008 責任著者 Satoshi TABATA (Kazusa DNA Research Institute)
データソース名 Lotus japonicus Genome Sequencing Project データソースURL http://www.kazusa.or.jp/lotus/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:93.5%[S:86.9%,D:6.6%],F:3.7%,M:2.8%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:79.8%[S:59.5%,D:20.3%],F:11.9%,M:8.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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