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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Gossypium tomentosum , Haiwaiian cotton , ワタ野生種 (tomentosum種), ハワイ野生ワタ

Gossypium tomentosum

Genome Assembly ID:t34277.G002

配列名:Gossypium_tomentosum_v1.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Gossypium_tomentosum_v1.1 系統名 isolate 7179.01
配列数 319 染色体数 2n = 4x = 52
配列長 (bp) 2,193,557,323 N50長 (bp) 102,861,178
遺伝子の数 112,713 遺伝子数由来ファイル GCA_007990485.1_Gossypium_tomentosum_v1.1_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 112,713 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel 取得した配列量 76.81x
アセンブリ方法 MECAT 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jane Grimwood (HudsonAlpha Institute for Biotechnology) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/s41588-020-0614-5 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.2%[S:2.8%,D:96.4%],F:0.6%,M:0.2%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.8%[S:4.6%,D:95.2%],F:0.1%,M:0.1%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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