Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Gossypium darwinii , Darwin's cotton , ワタ野生種 (darwinii種)

Gossypium darwinii

Genome Assembly ID:t34276.G001

配列名:Gossypium_darwinii_v1.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Gossypium_darwinii_v1.1 系統名 AD5-32, isolate 1808015.09
配列数 334 染色体数 2n = 4x = 52
配列長 (bp) 2,182,957,963 N50長 (bp) 101,902,339
遺伝子の数 97,407 遺伝子数由来ファイル GCA_007990325.1_Gossypium_darwinii_v1.1_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 97,407 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel 取得した配列量 80.57x
アセンブリ方法 MECAT 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jane Grimwood (HudsonAlpha Institute for Biotechnology) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/s41588-020-0614-5 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.3%[S:5.0%,D:94.3%],F:0.6%,M:0.2%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.8%[S:5.8%,D:94.1%],F:0.1%,M:0.1%,n:1614

遺伝子をさがす

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット