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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Echinochloa oryzicola , Late watergrass , タイヌビエ (oryzicola種)

Echinochloa oryzicola

Genome Assembly ID:t338574.G002

配列名:GWHBDNS00000000

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHBDNS00000000 系統名 ZJU2
配列数 370 染色体数 2n = 4x = 36
配列長 (bp) 945,562,925 N50長 (bp) 54,427,921
遺伝子の数 68,541 遺伝子数由来ファイル GWHBDNS00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Hi-C 取得した配列量 117x (Hi-C)
アセンブリ方法 DipHiC 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント The contig-level draft assemblies have been assembled previously (10.1016/j.molp.2020.07.001). The authers further used Hi-C data to anchor the contigs into chromosomes by using DipHiC.
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Chu-Yu Ye (Zhejiang University) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-022-28359-9 データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
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