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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Gnetum montanum , Gam nui, Sot nui , Gnetum montanum

Gnetum montanum

Genome Assembly ID:t3381.G001

配列名:G.montanum.final

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 G.montanum.final 系統名 XHMMT01
配列数 122,369 染色体数 2n = 44
配列長 (bp) 4,132,221,696 N50長 (bp) 156,939,799
遺伝子の数 27,354 遺伝子数由来ファイル G.montanum.final.pep.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina(PE, MP) 取得した配列量 69.10x(PE, 180 bp), 62.48x(PE, 300 bp), 57.52x(PE, 500 bp), 38.54x(MP, 2k bp), 38.32x(MP,5k bp), 30.66x(MP, 10k bp), 5.09x(MP, 15k bp)
アセンブリ方法 SOAPdenovo 推定ゲノムサイズ (Mb) 4200(flow cytometry), 4110(k-mer)
シーケンシングの方法のコメント insert size(PE):180 bp, 300 bp, 500 bp, insert size(MP): 2 kb, 5 kb, 10 kb, and 15 kb コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Xiao-Ming Wang (Shenzhen & Chinese Academy of Sciences) データソース名 DRYAD
論文 (DOIコード) 10.1038/s41477-017-0097-2 データソースURL https://datadryad.org
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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