配列名:G.montanum.final
ゲノム配列名 | G.montanum.final | 系統名 | XHMMT01 |
配列数 | 122,369 | 染色体数 | 2n = 44 |
配列長 (bp) | 4,132,221,696 | N50長 (bp) | 156,939,799 |
遺伝子の数 | 27,354 | 遺伝子数由来ファイル | G.montanum.final.pep.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina(PE, MP) | 取得した配列量 | 69.10x(PE, 180 bp), 62.48x(PE, 300 bp), 57.52x(PE, 500 bp), 38.54x(MP, 2k bp), 38.32x(MP,5k bp), 30.66x(MP, 10k bp), 5.09x(MP, 15k bp) |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 4200(flow cytometry), 4110(k-mer) |
シーケンシングの方法のコメント | insert size(PE):180 bp, 300 bp, 500 bp, insert size(MP): 2 kb, 5 kb, 10 kb, and 15 kb | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Xiao-Ming Wang (Shenzhen & Chinese Academy of Sciences) | データソース名 | DRYAD |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41477-017-0097-2 | データソースURL | https://datadryad.org |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |