Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Welwitschia mirabilis , Welwitschia , ウェルウィッチア, キソウテンガイ

Welwitschia mirabilis

Genome Assembly ID:t3377.G001

配列名:W.mirabilis.final

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 W.mirabilis.final 系統名 SZBG 00052740
配列数 22 染色体数 NA
配列長 (bp) 6,867,007,667 N50長 (bp) 359,756,438
遺伝子の数 26,990 遺伝子数由来ファイル W.mirabilis.final.new.pep.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Oxford Nanopore, Illumina 取得した配列量 108x(Oxford Nanopore), 134x(Illumina)
アセンブリ方法 WTDBG (version 1.2.8) 推定ゲノムサイズ (Mb) 7,000
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Used RNAseq for assembly
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Qingfeng Wang (Chinese Academy of Sciences) データソース名 DRYAD
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-021-24528-4 データソースURL https://datadryad.org
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット