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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Cryptomeria japonica , Japanese cedar , スギ

Cryptomeria japonica

Genome Assembly ID:t3369.G001

配列名:CJA_r1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 CJA_r1.0 系統名 GFA01029
配列数 2,741 染色体数 2n = 2x = 22
配列長 (bp) 9,239,540,489 N50長 (bp) 8,324,041
遺伝子の数 0 遺伝子数由来ファイル NA
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio 取得した配列量 24x
アセンブリ方法 Hifiasm 推定ゲノムサイズ (Mb) 9,890
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Res Inst) データソース名 BreedingTrees-by-Genes
論文 (DOIコード) 10.1101/2022.11.16.516598 データソースURL https://btg.kazusa.or.jp
BUSCO バージョン 5.0.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:89.0%[S:82.3%,D:6.7%],F:6.1%,M:4.9%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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