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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Pseudotsuga menziesii var. menziesii , Douglas-fir (var. menziesii) , ベイマツ (menziesii変種)

Pseudotsuga menziesii

Genome Assembly ID:t3357.G001

配列名:DougFir1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 DougFir1.0 系統名 var. menziesii, tree 412-2
配列数 1,236,665 染色体数 2n = 2x = 26
配列長 (bp) 14,673,225,455 N50長 (bp) 381,586
遺伝子の数 0 遺伝子数由来ファイル NA
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 61x
アセンブリ方法 SOAPdenovo2, MaSuRCA 2.3.2 推定ゲノムサイズ (Mb) 16,000
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 David B Neale (University of California at Davis) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1534/g3.117.300078 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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