配列名:Pabies01-genome
ゲノム配列名 | Pabies01-genome | 系統名 | clone Z4006 |
配列数 | 10,253,694 | 染色体数 | 2n = 2x = 24 |
配列長 (bp) | 12,301,351,591 | N50長 (bp) | 5,206 |
遺伝子の数 | 66,632 | 遺伝子数由来ファイル | Pabies1.0-all-pep.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina | 取得した配列量 | 38x (haploid PE reads), 55x (diploid PE reads), 55x (diploid long PE reads) |
アセンブリ方法 | CLC Assembly Cell Beta-4.0.6, BESST2, GAM-NGS | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 19,600 |
シーケンシングの方法のコメント | The assembly strategy combining fosmid pools with both haploid and diploid whole genome shotgun (WGS) data, and RNA sequencing (RNA-Seq) data. | コメント | synonym: Picea excelsa, Picea montana, Pinus abies |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Stefan Jansson (Umea University) | データソース名 | ConGenIE: Conifer Genome Integrative Explorer |
論文 (DOIコード) | 10.1038/nature12211 | データソースURL | http://congenie.org |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |