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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Picea abies , Norway spruce , ドイツトウヒ

Picea abies

Genome Assembly ID:t3329.G001

配列名:Pabies01-genome

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Pabies01-genome 系統名 clone Z4006
配列数 10,253,694 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 12,301,351,591 N50長 (bp) 5,206
遺伝子の数 66,632 遺伝子数由来ファイル Pabies1.0-all-pep.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 38x (haploid PE reads), 55x (diploid PE reads), 55x (diploid long PE reads)
アセンブリ方法 CLC Assembly Cell Beta-4.0.6, BESST2, GAM-NGS 推定ゲノムサイズ (Mb) 19,600
シーケンシングの方法のコメント The assembly strategy combining fosmid pools with both haploid and diploid whole genome shotgun (WGS) data, and RNA sequencing (RNA-Seq) data. コメント synonym: Picea excelsa, Picea montana, Pinus abies
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Stefan Jansson (Umea University) データソース名 ConGenIE: Conifer Genome Integrative Explorer
論文 (DOIコード) 10.1038/nature12211 データソースURL http://congenie.org
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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